資源簡介 第1節(jié)重組DNA技術(shù) 的基本工具 從社會中來 番木瓜容易受番木瓜環(huán)斑病毒的侵襲,當(dāng)番木瓜被這種病毒感染后,產(chǎn)量會大大下降。科學(xué)家通過精心設(shè)計(jì),用“分子工具”培育出了轉(zhuǎn)基因番木瓜,它可以抵御番木瓜環(huán)斑病毒DNA雙螺旋的直徑只有2 nm,對如此微小的分子進(jìn)行操作,是一項(xiàng)非常精細(xì)的工作,更需要專門的“分子工具”。 轉(zhuǎn)基因木瓜 環(huán)斑病毒的 非轉(zhuǎn)基因木瓜 限制性內(nèi)切核酸酶、DNA連接酶,載體。 限制性內(nèi)切核酸酶: DNA連接酶: 載體: 這些 “分子工具”各具有什么特征呢? 那么,科學(xué)家究竟用到了哪些“分子工具”? 準(zhǔn)確切割DNA分子,得到所需要的目的基因。 能將目的基因連接到載體上。 能將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞中。 一、限制性內(nèi)切核酸酶--“分子手術(shù)刀” 1、來源: 主要從原核生物中分離純化出來 2、種類: 迄今分離的限制酶有數(shù)千種 3、作用特點(diǎn): 具有專一性。具體表現(xiàn)如下 4、作用部位: 特定切點(diǎn)上的磷酸二酯鍵 5' 3' 5' 3' T A G G T A T C C A 磷酸二酯鍵 ①能夠識別雙鏈DNA分子中特定的核苷酸序列。 ②使每一條鏈中特定部位的磷酸二酯鍵斷開。 5、兩種常用的限制酶: 限制酶的命名是根據(jù)細(xì)菌種類而定,以EcoRI為例: E:Escherichia (屬) co:coli (種) R:RY13 (品系) I:首先發(fā)現(xiàn) 在此類細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的順序 EcoRⅠ:大腸桿菌(Escherichia coli)R型菌株中分離出的第一個限制酶; SmaⅠ:粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescens)中分離出的第一個限制酶。 EcoRⅠ和SmaⅠ 黏性末端 黏性末端 (1)EcoRI限制酶的切割: 當(dāng)限制酶在它識別序列得中軸線兩側(cè)將DNA分子的兩條鏈分別切開時,產(chǎn)生的是黏性末端。 只能識別GAATTC序列,并在G和A之間切開。 中軸線 中軸線 (2)SmaI限制酶的作用 只能識別CCCGGG序列,并在C和G之間切開。 當(dāng)限制酶在它識別序列中軸線處切開時,產(chǎn)生的是平末端。 在C和G之間切開 6、結(jié)果: 產(chǎn)生黏性末端或平末端 7、限制酶的識別序列的特點(diǎn) (1)大多數(shù)限制酶的識別序列由6個核苷酸組成。例如:EcoRⅠ、SmaⅠ (2)少數(shù)限制酶的識別序列由4個、8個或其他數(shù)量的核苷酸組成 (3)限制酶特異性識別和切割的部位具有回文序列 1.你能推測限制酶存在于原核生物中的作用是什么嗎? 破壞外源DNA,保護(hù)自我 2.為什么限制酶不剪切細(xì)菌本身的DNA? 缺乏特定的核苷酸序列 思考·討論 3.請寫出下列限制酶切割形成的黏性末端,并思考同種限制酶切割產(chǎn)生的黏性末端是否相同?不同限制酶切割產(chǎn)生的黏性末端是否一定不同? 同種限制酶產(chǎn)生的黏性末端相同, 不同的限制酶可能會形成相同的黏性末端。 4.請結(jié)合下圖,推斷限制酶切一次可斷開幾個磷酸二酯鍵?產(chǎn)生多少游離的磷酸基團(tuán)?產(chǎn)生幾個黏性末端?消耗幾分子水? 斷開兩個磷酸二酯鍵;產(chǎn)生2個游離的磷酸基團(tuán); 產(chǎn)生2個黏性末端;消耗兩分子水。 EcoRⅠ 黏性末端 ……CTACGATGAATTCCGTAGAATTCCCTAA…… ……GATGCTACTTAAGGCATCTTAAGGGATT…… ……CTACGATG ……GATGCTACTTAA AATTCCCTAA…… GGGATT…… AATTCCGTAG GGCATCTTAA 黏性 末端 目的基因 練習(xí):使用EcoRI剪切目的基因 G A A T T C C T T A A G G A A T T C C T T A A G G C T T A A A A T T C G G C T T A A A A T T C G 用同種限制酶切割(EcoRⅠ) 把兩種來源不同的DNA進(jìn)行重組,應(yīng)該怎樣處理? 缺口怎么辦? G C T T A A A A T T C G G C T T A A A A T T C G 二、DNA連接酶--“分子縫合針” 把切下來的DNA片段拼接成新的DNA分子,是靠DNA連接酶來完成的。即將雙鏈DNA片段“縫合”起來,恢復(fù)被限制酶切開的 。 DNA連接酶主要有兩類 : 、 。 2. E.coli DNA連接酶 T4 DNA連接酶 磷酸二酯鍵 1.DNA連接酶的作用 A G T C A T T C G A T A 可把黏性末端之間的縫隙“縫合”起來; (1)E.coli DNA連接酶 兩DNA片段要具有互補(bǔ)的黏性末端才能拼起來。 注意:DNA連接酶可連接雙鏈DNA中的DNA單鏈缺口,但不能將單個脫氧核苷酸連接到DNA鏈上! (2)T4 DNA連接酶 還可把平末端之間的縫隙“縫合”起來,但效率較低 C C C G G G G G G C C C DNA連接酶--“分子縫合針” 2 類型 來源 功能 相同點(diǎn) 差別 E·coli DNA連接酶 T4DNA連接酶 大腸桿菌 T4噬菌體 恢復(fù)磷酸二酯鍵 只能連接黏性末端 能連接黏性末端和 平末端(效率較低) DNA連接酶 DNA連接酶 A T A G T C C G A A T T 連接兩個DNA片段 與DNA聚合酶區(qū)別: C A A T T DNA聚合酶 G A G T A T C DNA聚合酶 連接單個脫氧核苷酸形成單鏈 DNA連接酶 DNA聚合酶 相同點(diǎn) 作用實(shí)質(zhì) 化學(xué)本質(zhì) 不 同 點(diǎn) 模板 作用對象 作用結(jié)果 用途 都能催化形成磷酸二酯鍵 都是蛋白質(zhì) 不需要 需要 形成完整的重組DNA分子 形成DNA的一條鏈 基因工程 DNA復(fù)制 3 DNA連接酶與DNA聚合酶的比較 只能將單個脫氧核苷酸連接到已有的DNA片段上,形成磷酸二酯鍵 在兩個DNA片段之間形成磷酸二酯鍵 名稱 作用部位 作用結(jié)果 限制酶 磷酸二酯鍵 將DNA切成兩個片段 DNA連接酶 磷酸二酯鍵 將兩個DNA片段連接為一個DNA分子 DNA聚合酶 磷酸二酯鍵 將單個脫氧核苷酸依次連接到單鏈末端 DNA(水解)酶 磷酸二酯鍵 將DNA片段水解為單個脫氧核苷酸 解旋酶 堿基對之間 的氫鍵 將雙鏈DNA分子局部解旋為單鏈,形成兩條長鏈 歸納總結(jié) 與DNA相關(guān)的五種酶的比較 根據(jù)所學(xué)知識,完成以下填空: ①限制酶 ②解旋酶 ③DNA連接酶 ④DNA聚合酶 ⑤RNA聚合酶 b a A.切斷a處的酶為_______ B.連接a處的酶為_______ C.切斷b處的酶為_______ ① ③④⑤ ② a:磷酸二酯鍵;b:氫鍵 練習(xí): 工具 分子手術(shù)刀 分子縫合針 分子運(yùn)輸車 限制性內(nèi)切核酸酶: DNA連接酶: 載體: 準(zhǔn)確切割DNA分子 得到所需要的目的基因 將DNA片段連接起來 即能將目的基因連接到載體上 將體外重組好的DNA分子導(dǎo)入受體細(xì)胞(即能將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞中) 質(zhì)粒(最常用) 作為載體,將外源基因送入受體細(xì)胞。 1.作用: 動植物病毒 噬菌體 2.種類: 三、基因進(jìn)入受體細(xì)胞的載體——分子運(yùn)輸車 質(zhì)粒是一種裸露的、結(jié)構(gòu)簡單的、獨(dú)立于真核細(xì)胞細(xì)胞核或原核細(xì)胞擬核DNA之外,并具有自我復(fù)制能力的雙鏈環(huán)狀DNA分子。 3、載體需具備的條件 (1)有一個至多個限制酶切割位點(diǎn),供外源DNA插入其中。 (2)能在細(xì)胞中進(jìn)行自我復(fù)制, 或整合到受體DNA上隨DNA同步復(fù)制 (3)有特殊的標(biāo)記基因,便于重組DNA的篩選。 如四環(huán)素抗性基因、氨芐青霉素抗性基因。 (4)對受體細(xì)胞無毒害作用,避免受體細(xì)胞受到損傷 實(shí)際上自然存在的質(zhì)粒DNA分子并不完全具備上述條件,都要進(jìn)行人工改造后才能用于基因工程操作。 標(biāo)記基因的篩選原理 載體上的標(biāo)記基因一般是某種抗生素的抗性基因,而受體細(xì)胞沒有抵抗該抗生素的能力。將含有某抗生素抗性基因的載體導(dǎo)入受體細(xì)胞,抗性基因在受體細(xì)胞內(nèi)表達(dá),受體細(xì)胞對該抗生素產(chǎn)生抗性。在含有該抗生素的培養(yǎng)基上,能夠生存的是被導(dǎo)入了載體的受體細(xì)胞。如圖所示: …ATAGCATGCTATCCATG AATTCGGCATAC… …TATCGTACGATAGGTACTTAA GCCGTATG… 目的基因 … TCCTAG … AGGATCTTAA AATTCCATAC … GAGCCATACTTAA AATTCTCGGTATG GGTATG … 實(shí)例:重組DNA分子的模擬操作 AATTCGGCATAC… …TATCGTACGATAGGTACTTAA …ATAGCATGCTATCCATG 目的基因 … TCCTAG … AGGATCTTAA AATTCCATAC … GAGCCATACTTAA AATTCTCGGTATG GGTATG … GCCGTATG… {5C22544A-7EE6-4342-B048-85BDC9FD1C3A} 載體的作用 載體的 必要條件 載體的種類 ①具一個或多個限制酶切點(diǎn),以便與外源基因連接。 ②能在宿主細(xì)胞中自我復(fù)制 或整合到受體DNA上隨受體DNA復(fù)制 ③具有某些標(biāo)記基因,便于重組DNA的篩選。 ①作為運(yùn)載工具,將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞中 ②在受體細(xì)胞內(nèi)對目的基因進(jìn)行大量復(fù)制 ①質(zhì)粒 ②病毒:噬菌體、動植物病毒等。 三、基因進(jìn)入受體細(xì)胞的載體--“分子運(yùn)輸車” 本節(jié)小結(jié) 基因工程 的工具 限制酶 主要存在于原核生物中 具有專一性(識別序列) 切開DNA分子的磷酸二酯鍵 產(chǎn)生黏性末端或平末端 DNA連接酶 連接磷酸二酯鍵 種類 E.coli DNA連接酶 T4 DNA連接酶 質(zhì)粒、噬菌體、動植物病毒 載體 具備的 條件 具一種至多種限制酶切點(diǎn) 具標(biāo)記基因 能在宿主細(xì)胞中自我復(fù)制 或整合到受體DNA上隨受體DNA復(fù)制 【典例】1.圖甲是含有目的基因的外源DNA片段,圖乙是用于將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞的質(zhì)粒(陰影部分表示抗生素抗性基因),相關(guān)限制酶的作用部位如圖所示,現(xiàn)欲培養(yǎng)轉(zhuǎn)基因抗病植株,回答下列問題。 (1)上述操作中不宜選用Sma I,原因是Sma I會破壞__________和 __________________。 (2)在基因工程的操作中,不宜選用EcoR I,原因是用EcoR I切割外源DNA片段后,_____________________________________________________。 抗病基因 抗生素抗性基因 目的基因只有一側(cè)含有黏性末端,不能插入到質(zhì)粒中 2.用限制酶切割時需注意的事項(xiàng) (1)獲取目的基因和切割載體時, 通常使用同種限制酶,目的是 。但是使用該法缺點(diǎn)是容易發(fā)生 ,為了避免上述情況發(fā)生,可采取的措施是 。 (2)獲取一個目的基因需限制酶切割 次,共產(chǎn)生 個游離的磷酸基團(tuán)。 (3)選擇限制酶切割位點(diǎn)的基本原則: ①切割目的基因時: 。 ②切割質(zhì)粒時: 。 為了產(chǎn)生相同的黏性末端,便于連接 兩 4 分別使用兩種限制酶去切割目的基因和運(yùn)載體 目的基因、質(zhì)粒的自身環(huán)化以及目的基因與質(zhì)粒反向連接 能切下目的基因且不破壞目的基因 至少保留一個完整的標(biāo)記基因,便于篩選 練習(xí)與應(yīng)用 3.如圖是培育表達(dá)人乳鐵蛋白的乳腺生物反應(yīng)器的技術(shù)路線 用圖2中的人乳鐵蛋白目的基因和圖1所示的質(zhì)粒構(gòu)建重組質(zhì)粒時,選用的限制酶是 (從“EcoRⅠ”“BamHⅠ/HindⅢ”“SmaⅠ/HindⅢ”中選擇).不能選擇其他限制酶的理由分別是: 。 BamHⅠ/HindⅢ 若選EcoRⅠ會破壞質(zhì)粒的復(fù)制原點(diǎn);若選SmaⅠ/HindⅢ,則構(gòu)建的重組質(zhì)粒沒有標(biāo)記基因或復(fù)制原點(diǎn) (1)限制性內(nèi)切核酸酶均能特異性地識別6個核苷酸序列( ) (2)DNA連接酶能將兩堿基間通過氫鍵連接起來( ) (3)E.coliDNA連接酶既可連接平末端,又可連接黏性末端( ) (4)限制酶和解旋酶的作用部位相同( ) (5)質(zhì)粒是雙鏈環(huán)狀DNA分子,是基因工程常用的載體。( ) × × × × √ 【基礎(chǔ)過關(guān)】 2.實(shí)驗(yàn)原理: 探究·實(shí)踐·DNA的粗提取與鑒定 (1)DNA不溶于酒精,但某些蛋白質(zhì)溶于酒精。 (2)DNA在不同濃度的NaCl溶液中溶解度不同,能溶于2mol/L NaCl溶液。 (3)在一定溫度下,DNA遇二苯胺試劑會呈現(xiàn)藍(lán)色。 0 0.14 NaCI濃度(mol/L) DNA溶解度 1.實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路: 四 DNA、RNA、蛋白質(zhì)和脂質(zhì)等在物理和化學(xué)性質(zhì)方面存在差異,可以利用這些差異,選用適當(dāng)?shù)奈锢砘蚧瘜W(xué)方法去除其他成分,對DNA進(jìn)行提取。 探究·實(shí)踐·DNA的粗提取與鑒定 四 DNA含量相對較高的生物組織,如新鮮洋蔥、香蕉、菠菜、菜花和豬肝等。 不能選擇哺乳動物成熟的紅細(xì)胞,因?yàn)椴溉閯游锍墒斓募t細(xì)胞中沒有細(xì)胞核和線粒體,幾乎不含DNA。 3.選材: 注意: 4.試劑: ①研磨液 ②體積分?jǐn)?shù)為95%的酒精 ③2mol/L的NaCl溶液 ④二苯胺試劑 ⑤蒸餾水 ——含有NaCl、EDTA、SDS、Tris和HCl ——析出DNA ——溶解DNA ——鑒定DNA,要現(xiàn)配現(xiàn)用 5.方法步驟 探究·實(shí)踐·DNA的粗提取與鑒定 四 析出DNA DNA的鑒定 研磨 稱取約30g洋蔥切碎,放入研缽中,倒入10mL研磨液,充分研磨。 過濾取上清液 在漏斗中墊上紗布,將洋蔥研磨液過濾到燒杯中,在4℃冰箱中放置幾分鐘后,再取上清液。 在上清液中加入體積相等的、預(yù)冷的酒精溶液(體積分?jǐn)?shù)為95%),靜置2~3min,溶液中出現(xiàn)的白色絲狀物就是粗提取的DNA。用玻璃棒沿一個方向攪拌,卷起絲狀物,并用濾紙吸去上面的水分; 取兩支試管,各加入2mol/L的NaCl溶液5mL。將絲狀物或沉淀物溶于其中一支試管的NaCl溶液中。然后,向兩支試管中各加入4mL的二苯胺試劑。混合均勻后,將試管置于沸水中加熱5min。 方法步驟 (視頻) 探究·實(shí)踐·DNA的粗提取與鑒定 四 注意事項(xiàng) 1.以血液為實(shí)驗(yàn)材料時,每100 mL血液中需要加入3 g檸檬酸鈉,防止血液凝固。 2.利用動物細(xì)胞提取DNA破碎細(xì)胞的方法:動物細(xì)胞無細(xì)胞壁,可直接吸水漲破。 3.加入研磨液后,必須充分研磨,否則細(xì)胞核不會充分破碎,釋放出的DNA量就會減少。 4.加入酒精和用玻璃棒攪拌時,動作要輕緩,以免加劇DNA分子的斷裂,導(dǎo)致DNA分子不能形成絮狀沉淀。 5.預(yù)冷的酒精具有以下優(yōu)點(diǎn):①可抑制核酸水解酶的活性,進(jìn)而抑制DNA降解;②抑制分子運(yùn)動,使DNA易形成沉淀析出;③低溫有利于增加DNA分子的柔韌性,減少其斷裂。 探究·實(shí)踐·DNA的粗提取與鑒定 四 1.你提取出白色絲狀物或沉淀物了嗎?用二苯胺試劑鑒定的結(jié)果如何? 2.你能分析出粗提取的DNA中可能含有哪些雜質(zhì)嗎? 結(jié)果分析與評價(jià) 觀察提取的DNA的顏色,如果不是白色絲狀物,說明DNA中的雜質(zhì)較多。二苯胺試劑鑒定呈現(xiàn)藍(lán)色說明實(shí)驗(yàn)基本成功;如果不呈現(xiàn)藍(lán)色,可能的原因有所提取的DNA含量低,或者在實(shí)驗(yàn)操作過程中出現(xiàn)了失誤等。 本實(shí)驗(yàn)粗提取的DNA可能仍然含有核蛋白、多糖等雜質(zhì)。 探究·實(shí)踐·DNA的粗提取與鑒定 四 進(jìn)一步探究 實(shí)驗(yàn)室提取純度較高的DNA的方法有不少。例如,可以先添加質(zhì)量分?jǐn)?shù)為25%的SDS溶液,使蛋白質(zhì)變性后與DNA分開;隨后,加入氯仿—異丙醇混合液(體積比為24:1),通過離心將蛋白質(zhì)及其他雜質(zhì)除去,取上清液;可重復(fù)上述操作幾次,直至上清液變成透明的黏稠液體。此外由于苯酚可以迅速使蛋白質(zhì)變性,抑制核酸酶的活性,因此還可以先用苯酚處理,然后離心分層,這時DNA溶于上層水相,蛋白質(zhì)變性后存在于酚層中,用吸管、微量移液器等實(shí)驗(yàn)用具就可以將兩者分開。 探究·實(shí)踐·DNA的粗提取與鑒定 四 3.與其他同學(xué)提取的DNA進(jìn)行比較,看看實(shí)驗(yàn)結(jié)果有何不同,分析產(chǎn)生差異的原因。 刑偵破案 拓展:DNA提取的應(yīng)用 基因組測序 插入人胰島素基因的大腸桿菌 基因工程 親子鑒定 探究·實(shí)踐·DNA的粗提取與鑒定 四 練習(xí)與應(yīng)用 一、概念檢測 1.DNA連接酶是重組DNA技術(shù)常用的一種工具酶。下列相關(guān)敘述正確的是 A.能連接DNA分子雙鏈堿基對之間的氫鍵 B.能將單個脫氧核苷酸加到DNA片段的末端,形成磷酸二酯鍵 C.能連接用同種限制酶切開的兩條DNA片段,重新形成磷酸二酯鍵 D.只能連接雙鏈DNA片段互補(bǔ)的黏性末端,不能連接雙鏈DNA片段的平末端 2.在重組DNA技術(shù)中,將外源基因送入受體細(xì)胞的載體可以是 A.大腸桿菌的質(zhì)粒 B.切割DNA分子的酶 C.DNA片段的黏性末端 D. 用來識別特定基因的DNA探針 C A 二、拓展應(yīng)用 1.想一想,為什么限制酶不切割細(xì)菌本身的DNA分子? 提示:細(xì)菌中限制酶之所以不切割自身的DNA,是因?yàn)楹心撤N限制酶的細(xì)胞的DNA分子不具備這種限制酶的識別序列,或者通過甲基化酶將甲基轉(zhuǎn)移到了限制酶所識別序列的堿基上,使限制酶不能將其切開。這樣,盡管細(xì)菌中含有某種限制酶,也不會使自身的DNA被切斷,并且可以防止外源DNA入侵。 2.有2個不同來源的DNA片段A和B,A片段用限制酶SpeI進(jìn)行切割,B片段分別用限制酶HindⅢ、XbaI、EcoRV和XhoI進(jìn)行切割。各限制酶的識別序列和切割位點(diǎn)如下。 (1)哪種限制酶切割B片段產(chǎn)生的DNA片段能與限制酶SpeI切割A(yù)片段產(chǎn)生的DNA片段相連接?為什么? XbaⅠ。因?yàn)閄baI與SpeI切割產(chǎn)生了相同的黏性末端。 2.有2個不同來源的DNA片段A和B,A片段用限制酶SpeI進(jìn)行切割,B片段分別用限制酶HindⅢ、XbaI、EcoRV和XhoI進(jìn)行切割。各限制酶的識別序列和切割位點(diǎn)如下。 (2)不同的限制酶切割可能產(chǎn)生相同的黏性末端,這在基因工程操作中有什么意義? 提示:識別DNA分子中不同核苷酸序列,但能切割產(chǎn)生相同黏性末端的限制酶被稱為同尾酶。同尾酶使構(gòu)建載體時,切割位點(diǎn)的選擇范圍擴(kuò)大。例如,我們選擇了用某種限制酶切割載體,如果目的基因的核苷酸序列中恰好含有該限制酶的識別序列,那么用該限制酶切割含有目的基因的DNA片段時,目的基因就很可能被切斷;這時可以考慮用合適的同尾酶(目的基因的核苷酸序列中不能有它的識別序列)來獲取目的基因。 展開更多...... 收起↑ 資源預(yù)覽 縮略圖、資源來源于二一教育資源庫